In Snoucks laatste jaren in Nederlands-Indië is hij getrouwd met Siti Sadijah, die ook wel ‘Buah’ wordt genoemd. Zij is de dochter van de kalipah, de plaatsvervangend hoofdpenghoeloe van Bandoeng hadji Moehamad Soe’eb, lokaal beter bekend als ‘Kalipah Apo’. Snouck noemt haar ‘mijn geliefde Soendanese prinses’. Beiden krijgen in januari 1905 een zoon, Joesoef. Wanneer Snouck naar Nederland vertrekt, laat hij Buah en zijn kinderen op Java achter. Voor elk van zijn kinderen sluit hij een lijfrenteverzekering af zodat ze kunnen rekenen op een maandelijkse financiële uitkering vanaf het moment dat ze 21 jaar oud zouden worden.
Familieportret Snouck v.l.n.r. Ibrahim, Aminah, Emah en Oemar en voor Lasmita Koesoema en Nuah met Joesoef, 1906-1907, Collectie nazaten van Snouck Hurgronje in Indonesië, Bandung