Mulai tahun 1874 Chris Snouck menempuh studi teologi di Universitas Leiden, antara lain pusat pengkajian ilmiah Alkitab. Pada awalnya Abraham Kuenen, Guru Besar Perjanjian Lama, merupakan gurunya yang terpenting – guru besar ini terkenal berkat rekonstruksi sejarah lahirnya buku-buku Alkitab Kristen. Di samping teologi, Snouck juga mengambil studi kesusastraan Semit. Pada tahun 1879 dia menyelesaikan jurusan studinya ini pada guru keduanya, pakar Arab Michael Jan de Goeje.
Jan Goedeljee, Academiegebouw, Rapenburg 73, Leiden, dilihat dari tingkat atas rumah di sisi timur Rapenburg (pojok Kloksteeg) ke arah barat laut, 1870, Erfgoed Leiden en Omstreken, inv.nr. PV_GN006484