Pada awal 1910 Snouck yang saat itu berusia 53 tahun menjalin hubungan dengan Ida Oort yang berusia 36 tahun, putri Abraham Oort, mantan pendeta Jemaat Gereja Hervormd di Zutphen. Pada 8 Juli mereka menikah. Pada Desember 1914 lahir putri mereka, Christien. Christien mengambil studi bahasa-bahasa klasik di Leiden. Pada 1936 Christien mendampingi ayahnya di saat-saat sebelum menghembuskan napasnya yang terakhir.
Snouck dan putrinya Christien, sekitar tahun 1927, koleksi keturunan Snouck Hurgronje di Indonesia, Bandung